Čakajovce ležia v juhovýchodnej časti sprašovej Nitrianskej pahorkatiny na pravostrannej nive a terase Nitry v blízkosti sútoku s Radošinou. Odlesnený chotár tvoria mladotreťohorné usadeniny. Má nivné a černozemné pôdy. Nadmorská výška obce v jej strede je 147 m, v jej chotári je 140 - 187 m.
Zdroj: Vlastivedný slovník obcí na Slovensku, 1. časť